氣質(zhì)聯(lián)用儀GC-MS檢測中選用衍生化試劑除了和氣相色譜中選擇衍生化試劑相同的準(zhǔn)則以外，還應(yīng)注意到衍生化產(chǎn)物的質(zhì)譜特性：質(zhì)量碎片特征性強，分子量適中，適合質(zhì)量型檢測器檢測，也有利于與基質(zhì)干擾物分離。

在GC-MS分析實際樣品時，對羥基、胺基、羧基等官能團進行衍生化往往起著十分重要的作用。

氣質(zhì)聯(lián)用儀GC-MS衍生化有不少益處，例如：

1，改善了待測物的氣相色譜性質(zhì)。待測物中一些極性較大的基團的存在，如羥基、羧基等氣相色譜特性不好，在一些通用的色譜柱上不出峰或峰拖尾，衍生化以后，情況改善。

2，改善了待測物的熱穩(wěn)定性。某些待測物，熱穩(wěn)定性不夠，在氣化時或色譜過程中分解或變化，衍生化以后，待測物定量轉(zhuǎn)化成在GC-MS測定條件下穩(wěn)定的化合物。

3，改變了待測物的分子質(zhì)量。衍生化后的待測物絕大多數(shù)是分子量增大，有利于使待測物和基質(zhì)分離，降低背景化學(xué)噪音的影響。

4，改善了待測物的質(zhì)譜行為。大多數(shù)情況下，衍生化后的待測物產(chǎn)生較有規(guī)律、容易解釋的質(zhì)量碎片。

5，引入鹵素原子或吸電子基團，使待測物可用化學(xué)電離方法檢測。很多情況下可以提高檢測靈敏度，檢測到待測物的分子量。

6，通過一些特殊的衍生化方法，可以拆分一些很難分離的手性化合物。

當(dāng)然，氣質(zhì)聯(lián)用儀GC-MS的衍生化方法應(yīng)用不當(dāng)，也會帶來一些弊端，

例如：

1，柱上衍生化有時會損傷色譜柱。

2，某些衍生化試劑需在氮氣氣流中吹干除去，方法不當(dāng)會有損失。

3，衍生化反應(yīng)不*，會影響靈敏度。

4，衍生化試劑選用不當(dāng)，有時會使待測物分子量增加過多，接近或超過一些小型質(zhì)譜檢測器的質(zhì)量范圍。